We hebben Lara Croft in de vorige game zien uitgroeien tot de Tomb Raider die we allemaal kennen. Maar wat doe je na zo'n avontuur waarin je belaagd werd door paranormale gevaren? Door naar het volgende avontuur, natuurlijk! Lara gelooft nu dat er meer is tussen hemel en aarde en besluit in de voetsporen van haar overleden vader te treden. Lord Croft was op zoek naar een artefact dat mensen onsterfelijk maakt. Zijn resultaten werden bekritiseerd door de academische wereld, maar Lara vermoedt dat er toch een kern van waarheid in zit. Ze wil het onderzoek van haar vader afmaken, ook om zijn naam te zuiveren.